Olivier Borkowski

Olivier Borkowski

CR INRAE

Lors de ma thèse en France, j'ai travaillé sur le lien entre taux de croissance et production de protéines chez les bactéries en utilisant une approche de biologie des systèmes dans les équipes du Dr S. Aymerich et Dr V. Fromion. Après ma thèse (1) j'ai utilisé des approches de biologie synthétique pour coupler physiologie cellulaire et production de protéines en utilisant des portes logiques moléculaires (à Stanford chez le Pr D. Endy), (2) j'ai travaillé sur des méthodes de production de protéines acellulaires dites cell-free (à l'Imperial Collège de Londres chez le Pr T. Ellis), (3) j'ai développé des méthodes liant cell-free et machine learning pour maximiser la production de protéines in vitro (au Génopole à Évry dans l’équipe de Pr. JL Faulon) et (4) j'ai mis en place des approches d'automatisation en biologie et des outils d’optogénétiques pour la conception de circuits synthétiques chez la levure (à l'Institut Pasteur chez le Dr G. Batt). Ma recherche actuelle à Micalis chez le Pr Matthieu Jules (SyBER) porte sur l’utilisation de méthodes cell-free pour accéder à l’expression génétique d’organismes non-cultivable du microbiote intestinal.  

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