Dynamique des génomes de bactériophages

François Lecointe est un spécialiste du NHEJ bactérien. Il s'intéresse aux mécanismes de recombinaison originaux codés par les bactériophages. Il dirige actuellement deux projets portant sur les SSAP (single strand annealing protein) Sak4 du coliphage HK620 et RecT du coliphage Gally.

Marianne De Paepe cherche à caractériser les pressions évolutives exercées sur les phages tempérés intestinaux. Elle dirige un projet autour de l'impact des phages tempérés sur la dynamique du microbiote intestinal, en utilisant des souris sans germes inoculées avec des écosystèmes simplifiés, composés d'Escherichia coli, Faecalibacterium prausnitzii, et Roseburia intestinalis.

Marie-Agnès Petit étudie les populations virales d'écosystèmes digestifs ou alimentaires, et leur impact sur la fraction bactérienne de l'écosystème.  Elle développe aussi en collaboration des outils pour la comparaison des génomes de phages et leur annotation.